心理咨询师证书的发证机关通常由国家或地区的心理卫生和心理健康领域主管部门负责，心理咨询师证书的发证机关是中华人民共和国人力资源和社会保障部下属的国家卫生健康委员会（National Health Commission of the People's Republic of China），简称国家卫健委。
具体到操作层面，心理咨询师的培训、考核与发证流程如下：
1、培训与教育：个人需要参加由国家卫健委或其指定的机构举办的心理咨询师培训班，学习相关的心理学理论知识、心理咨询技术以及相关法律法规。
2、考试报名：完成培训后，学员需要报名参加国家卫健委组织的心理咨询师资格考试，考试通常分为理论考试和实操考试两部分，理论考试主要测试心理学基础知识和相关法规，而实操考试则侧重于评估考生的心理咨询技能。
3、考试通过：考生在理论和实操考试中均达到合格标准后，方可获得心理咨询师资格证书。
4、证书发放：一旦考试通过并满足其他相关条件，如继续教育和职业道德要求，心理咨询师即可向国家卫健委申请领取正式的心理咨询师证书。
5、持续教育：获得证书后，心理咨询师需定期参加继续教育课程，以保持其专业知识和技能的更新。
6、职业道德：心理咨询师在执业过程中应遵循职业道德规范，保护客户隐私，提供专业服务，不得进行非法或不道德的咨询活动。
7、职业资格认证：心理咨询师的专业资格认证是由国家卫健委颁发的《心理咨询师职业资格证书》，该证书在全国范围内有效。
8、注册备案：取得《心理咨询师职业资格证书》后，需要在国家卫健委进行注册备案，才能合法从事心理咨询工作。
9、持证上岗：持有《心理咨询师职业资格证书》的心理咨询师可以在相应的机构注册后，开始接受客户的咨询，开展心理辅导工作。
需要注意的是，不同国家和地区对于心理咨询师的发证机关可能有所不同，在美国，心理咨询师的资格认证通常由各州的心理健康部门颁发；在英国，心理咨询师的资格认证则由英国心理学会（BPS）颁发，心理咨询师的资格认证则是由国家卫健委颁发的《心理咨询师职业资格证书》。
