心理咨询师证书是由国家卫生健康委员会（原卫生部）和人力资源和社会保障部共同颁发的，根据中国国务院机构改革方案，这两个部门于2018年整合，成立了国家卫生健康委员会，心理咨询师证书的颁发工作也由国家卫生健康委员会负责。
心理咨询师证书的颁发流程如下：
1、报名：考生需要通过国家卫生健康委员会官方网站或其他指定渠道进行报名，报名时，考生需要填写个人信息、学历背景、工作经验等相关信息。
2、审核：国家卫生健康委员会对报名人员进行资格审核，审核内容包括学历、工作经历、职业道德等方面，审核通过后，考生将获得考试资格。
3、考试：考生需要在指定的时间和地点参加国家卫生健康委员会组织的心理咨询师资格考试，考试分为理论和实践两部分，主要测试考生的心理学知识和心理咨询技能。
4、成绩公布：考试成绩将在考试结束后的一定时间内公布，考生可以通过国家卫生健康委员会官方网站查询自己的考试成绩。
5、领取证书：考生在成绩合格后，需要按照国家卫生健康委员会的要求进行证书领取，领取证书时，考生需要提供身份证原件及复印件、准考证原件及复印件等相关材料。
6、注册：领取证书后，考生需要进行注册，注册时，考生需要提供身份证原件及复印件、学历证明、工作经历证明等相关材料，注册成功后，考生即可在全国范围内开展心理咨询工作。
心理咨询师证书的颁发对于提高心理咨询行业的整体水平具有重要意义，通过国家卫生健康委员会的严格审核和认证，确保了心理咨询师具备一定的专业知识和技能，能够为患者提供专业、安全的心理咨询服务，心理咨询师证书还有助于提高公众对心理问题的认识，促进心理健康教育的发展。
